Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体转化的差异性

2021-11-22 03:43:42 来源:
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细胞核骨架通过促进或抑制作用该骨架的转录可以高度集当中突变组的动态和细胞身份认定。这些细胞核骨架当中发挥作用特定的酪氨酸翻译后结构上(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录稳定状态具体,并可促进抑制作用性等位基因骨架的形成,影响突变的传达。为了在减数分裂时即便如此保持稳定突变传达程序的完整性,立即细胞核骨架的分子特征也只能在子代细胞当中设立。设立各有不同类同型细胞核稳定状态的重要立即因素是酪氨酸PTMs,合而为一要发挥作用于酪氨酸H3和H4的尾巴上。因此,在减数分裂的过程当中,除了DNA脱氧核糖核酸,杂交核小体也只能重建,并分摊到子代细胞当中。显然,研究成果挖掘出杂交的经典酪氨酸(比如脱氧核糖核酸忽视的酪氨酸)会在脱氧核糖核酸叉后进一步原先出厂。各有不同的研究成果组挖掘出H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传。然而,这两个酪氨酸结构上都是与抑制作用性细胞核骨架具体。那么,杂交当中的核小体,以及它们载运的酪氨酸PTMs是否都能遗传到子代细胞相同的突变一层楼上呢?来自纽约大学兰戈恩综合医院的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表研究成果Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该研究成果挖掘出在DNA脱氧核糖核酸时,抑制与颇受抑制作用细胞核地带的核小体剥离是各有不同的。颇受抑制作用细胞核骨架当中的核小体会被迁移在子代细胞相同的突变地带,而抑制同型细胞核骨架当中的核小体的分摊则是球状和随机的。为研究成果核小体的剥离状况,研究成果者在候选突变一层楼举例来说标明酪氨酸H3.1和H3.2,以小鼠体细胞干细胞当中核小体在减数分裂时的变化。简单来说,该方法通过邻近抗原标明技术,利用CRISPR为特定突变一层楼的H3.1和H3.2拿着谷氨酸标明,经ChIP-qPCR测定该谷氨酸标明在细胞周期G1期和S期的丰度,以反应会核小体的剥离状况。若该核苷酸H3.1和H3.2上的谷氨酸标明在一次减数分裂后下降一半,概述该核小体被迁移在了两个子代细胞的相同突变一层楼上;若该谷氨酸结构上便消失,概述子代细胞并未遗传该突变一层楼的核小体。研究成果者首先测定了在体细胞干细胞当中沉默传达的Hoxc6, Ebf1, Meis2突变的核小体剥离状况。这些突变一层楼的核小体谷氨酸程度随减数分裂逐渐减半,这提示颇受抑制作用的突变一层楼的核小体会被迁移在子代细胞的相同位置。这与前人挖掘出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传的现像相印证。那么,抑制同型细胞核地带的核小体又是如何剥离的呢?研究成果者测定了在体细胞干细胞当中被抑制传达的Ccna2, Nanog和Pou5f1突变,挖掘出该突变一层楼的谷氨酸标明在减数分裂后呈球状稳定状态,丰度很低,这提示对于抑制同型细胞核地带来说,杂交核小体不会准确的分摊到子代细胞相应的突变一层楼,而是随机分摊的。更有意思的是,在诱导体细胞干细胞分化时,Hoxc6突变由抑制作用转为抑制,它的核小体分摊模式也由准确的同核苷酸分摊改为随机分摊。这概述杂交核小体的局部分摊,可以反映该细胞核地带的活性稳定状态。总的来说,该研究成果通过CRISPR引导的酪氨酸谷氨酸标明系统,研究成果了核小体在减数分裂过程当中的分式,并挖掘出抑制与颇受抑制作用的细胞核地带的核小体分式的各有不同。值得注意的是,在细胞周期的S期当中,颇受抑制作用的细胞核地带的脱氧核糖核酸要晚于抑制同型细胞核地带。这个等待时间差可称也导致;也细胞核的脱氧核糖核酸速度极小可称细胞核。可称细胞核相比之下更慢的脱氧核糖核酸速度可能确保了核小体的准确分摊,而;也细胞核当中的PTMs则由相应的合而为一调节因子(master regulators)直接识别相应DNA序列,并招募PTMs酶原先设立。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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