2021年结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识公布，要点一览！

缘帕金森氏症在我国的生育率呈据统计上升的急遽，世 界卫生的组织世界性癌症分析机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据显示，我国 2020 年缘直 肠癌的新发病症例数为 56 万例，因缘帕金森氏症丧生病症例达 29 万例 。 约 25%的缘帕金森氏症患者在病症症时已显现出远 处集中于，此外，25%的患者在治疗法现实生活之此前发生集中于，中期 患者预后较差，5 年生存率太少下 15%。 分子可遥相呼应仍须 测定是配对载体治疗法获颁益人群的此前里斯，近年来随着探测定 应用的快速增长，蛋白质分子可生命体学，也称做这一代分子可生命体学( next generation sequencing，NGS)，因其在通量、转成本高及效率 等层面的总合优势，在遗传遗传型探测定之此前呈现出越 来越广阔的应当用领域此机遇。 然而 NGS 探测定应用流程复杂， 对测定试室环境条件、技术人员能力及低质量管理要求高，任何 一个环节显现出情况，均有影响探测定缘果的准确性，进而影响临床研究决策。

为保的证临床研究诊疗工来作的准确性和准则性，本共识由临床研究医师缘合缘帕金森氏症实际诊疗需求发起，业内诸多探测定公司参与，病症理及仍须查科学家指导工作，从缘帕金森氏症 NGS 探测定的临床研究并不一定及测定试室流程质控并不一定共同起草华北地区科学家共识，以指导工作 NGS 探测定应用在缘帕金森氏症诊疗之此前的准则应当用领域。

1，生命体遥相呼应在缘帕金森氏症之此前的临床研究意义

现阶段较指明的肠癌特别遗传性疾病症主要有 3 类:Lynch 总合征、家族性腺瘤肉病症 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和横纹浸润病症（P⁃J 总合征）。 同时《华北地区临床研究学术评议会 ( CSCO) 缘帕金森氏症诊疗指南 2020 版》 针对遗传性缘帕金森氏症筛查和遗传病症症规章了原则。

FAP 力荐开展 APC 肽链分子可生命体学/相片缺失分子可生命体学，有遗传型里斯示 FAP 或衰减型 FAP(AFAP);无遗传型 则力荐行 MUTYH 肽链分子可生命体学 / 相片缺失分子可生命体学，有突 变里斯示 MUTYH 特别浸润病症(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已知的浸润病症总合征遗传 的病症原生物体，正因如此多遗传遗传型探测定，多遗传 Panel 应当以外所有浸润和缘帕金森氏症特别遗传。

缘帕金森氏症之此前常见 TMB 仍须视分析方法及探测定全域汇总

TMB 探测定有助于帮助配对免除疫治疗法潜在获颁 益的患者，突出里斯升中期恶性患者的客观性缓 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 有时候也伴随 TMB⁃H，MSI⁃H 抽取之此前有约 83%观感为 TMB⁃H，且有 97%的抽取 TMB≥10 Muts/ Mb。 在临床研究分析和实践中现实生活之此前，TMB 的风险评估仍须视国际标准 在不同癌种之此前共存差异，而不同载体分子可生命体学 Panel 的 TMB 探测定法制间 TMB 阈值不能通用。

患者规章特别治疗法方案的现实生活，缘合缘帕金森氏症生命体遥相呼应特别临床研究意义，决定探测定来作如下力荐 ：

2，抽取处理过程及转运

FFPE 抽取为保的证蛋白质低质量，治疗或活仍须

的组织应当在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 醛氢氧化钠之此前开展相同，避免除用来作酸性及含有重金属 阳离子的相同液。 其之此前，大遗骸相同等待时间为 6 ~ 48 h，不超过 72 h;小活仍须体可相同 6 ~ 12 h。 对 其之此前 1 张 FFPE 抽取开展昂片腌渍，并在显微镜 下观察巨噬细胞的摄取和数量。 若摄取不 足下，则测定试室需对通过富含后完全符合低质量要求的 遗骸开展风险评估，或者高纯度转成 FFPE 巨噬分子可生物学蜡块后 开展蛋白质里斯炼出。 例外的是，开展 NGS 探测定此前 应当通过 HE 腌渍风险评估巨噬细胞摄取，最少满足下肿 瘤巨噬细胞摄取在 20%以上。

治疗或活仍须的新鲜的组织抽取

新鲜的组织可里斯炼出到高低质量的蛋白质。 新鲜的组织应当在离体 30 min 内 将其存放于液氮罐或者-80 °C 冰箱之此前，尽量减少 RNA 等 蛋白质降解。 如需风险评估巨噬细胞摄取，可运用于浓缩昂 片腌渍体分析方法，若巨噬细胞摄取太少下，可通过标记 地带开展富含。 新鲜的组织可在液氮、-80 °C 冰 箱或稳定剂之此前长期存放。

血红素抽取

对于共存于血红素之此前的可逆 DNA， 即 ctDNA，取样时可用来作专用的 ctDNA 存放管辅以血， 辅以血后轻柔相异 8 ~ 10 次，维护辅以腹腔之此前的 ctDNA 存放液与肝脏充份混匀，气态转运存放即可，禁止 冻融肝脏;到达测定试室后，分开血红素，里斯炼出其会 DNA[26] 。 也可用来作一次性 EDTA 抗凝热力辅以腹腔， 辅以集 8 ~ 10 ml 全血，冷藏运再多，2 h 内分开血红素，里斯 取其会 DNA，如需存放，代为置于-80 °C 冰箱之此前，并避 免除反复冻融。

抽取运送至准则

送至国际标准配置准则( SOPs) 以维护运送至现实生活之此前各类样 本的安全性和现实生活的可控性(详见第 4 节)。 石蜡 材料可以气态运再多，肝脏抽取需在干冰条件下运 再多，蛋白质抽取需在 4 °C或浓缩条件下运再多。

3，简报探究及国际标准巨集

NGS 临床研究简报包含内容

遗传探测定的临床研究报 告应当当以外:(1)基础电子邮件:测定试室名称、测定试操 来作技术人员、简报审核技术人员、获知。 (2)受仍须者的 基本电子邮件:应当以外受仍须者姓名、性别、出生日期、 接受探测定的日期、探测定的目的和受仍须者的临床研究指 征等。 (3)抽取的电子邮件:抽取类型，如 DNA、外周血、唾液、新鲜的组织、FFPE 的组织等;辅以集等待时间和辅以 集口腔、抽取编号、向警方等待时间、探测定简报等待时间和样 本主要质控情况，如 DNA 低质量风险评估以及分子可生命体学质 量风险评估等。 (4)探测定计划:遗传 Panel 的探测定位 点及 仍须 测定 范 屯、 仍须 测定 仪 器、 仍须 测定 试 剂， 是 否 为 NMPA 批准用来作的探测定氢化以及 NMPA 获颁批的 遗传底物电子邮件，或测定试室自增建探测定( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 氢化、探测定分析方法、探测定全域、仍须 测定千分之(LoD)等。 (5)探测定缘果及生物体探究:对 遗传生物体的探测定缘果开展探究，如仍须出的遗传 型、生物体缘果、腌渍体变化情况、探测定缘果的病因症 性AO、抗生素电子邮件及临床研究意义、生物体探究引用的 概述史籍等。 (6)标注探测定分析方法的测定试室内部验 的证缘果，探测定显然及不确定性，进一步探测定的 决定。

遗传生物体的定名为

对遗传生物体的描述应当遵循 一定的原则和准则，力荐用来作生物分子可生命体学生物体协会 定名为指南(www.hgvs.org)，转录本的选择决定运用于遗传座概述分子可生命体学蛋白质在线( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 概括的转录本或者多个世界性在线公认的主要转录本。 对遗传性缘帕金森氏症特别遗传生物体的所述，决定以美国医学遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)指南为国际标准，在探测定缘果之此前列出具体的生物体底物电子邮件，以外遗传名称、所概述的生物分子可生命体学版本号、转录本概述蛋白质版本号、核苷酸生物体、生物体、肽链 / 内含子依序、等位遗传杂合性、腌渍体编号及坐标等等。

临床研究意义的探究和批注

对于体巨噬细胞遗传型，运用于AO处理过程的方式 总合伴随病症症、临床研究指南、在线或史籍的迹象，可 以将体巨噬细胞遗传遗传型可分临床研究意义指明(I 级)、有潜在临床研究意义(II级)、临床研究意义不指明(III 级) 和良性或可能良性遗传型( IV级) 。 测定试室需创增建分类及AO和简报的 SOPs，SOPs 应当最少以外两 个层面:(1) 对体巨噬细胞遗传遗传型开展AO的流程; (2)在日常探测定之此前简报哪一级或哪几级遗传型底物。 AO的流程应当有记录，以外的迹象相关联的指南、史籍、 在线、的迹象一般来说、AO缘果等。 临床研究的迹象决定突 变底物AO，可根据《蛋白质分子可生命体学应用临床研究准则化 应当用领域北京科学家共识》发表的体巨噬细胞遗传型底物和临 床的迹象可分以下 4 级。

对胚系遗传型的探测定

除了之此前外诊疗指南及 重要概述史籍外，另有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和美国 ACMG 可概述。 ACMG 指南将生物体底物病症原的一般来说可分病因症、有误 似病因症、临床研究意义未明、有误似良性和良性 5 个一般来说。 简报之此前应当列出与遗传性缘帕金森氏症(如 FAP、Lynch 综 合征等)特别的病因症以及有误似病因症生物体，并对生物体 的病症原开展分析探究[28] 。

意义不明底物的处理过程

无论是体巨噬细胞 遗传型，或是胚系遗传型，都共存意义不明底物。 测定试 室需规章特别政策用来确定究竟简报或者不简报 临床研究意义不明的底物，并附上所述和概述在线， 并且要在简报之此前指明本测定试室出具临床研究简报的 规则。

DPYD 探测定缘果

之此前等新陈代谢型患者，应当基于 活性分值降低起始剂量;慢新陈代谢型应当避免除用来作氟大便嘧 啶及其此前体抗生素。 UGT1A1 探测定缘果之此前，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合生物体型或双杂合生物体型的患者应当降低 伊立替康的剂量，力荐剂量为 150 mg / m2 。

低丰度遗传型缘果的处理过程

对抽取开展 NGS 仍须 测定时如显现出较低丰度的遗传型缘果( 有时候的组织学抽取极低 5%，肝脏抽取极低 1%或极低探测定 LoD)时，增建 议总合风险评估 NGS 测定试平台性能、分子可生命体学深以及 巨噬细胞比重等因素总合考虑。 尤其对于载体治疗法相 关的遗传决定用来作其他探测定分析方法开展进一步验的证 确认(如 Sanger，dPCR 等)。

知晓同意

决定里斯供患者副本或者在线版的知晓书。

简报巨集

测定试室应当根据探测定计划，给出相关联当 的探测定简报巨集(表 7)，并转成型 SOP 文件。 巨集之此前 应当指明列出探测定简报之此前应当里斯供的电子邮件，如患者基本 电子邮件、抽取电子邮件、探测定电子邮件、探测定缘果、缘果断言、实 验室电子邮件、探测定分析方法的显然以及其他内容等。

原始原文

华北地区抗癌协会载体治疗法专业评议会.缘帕金森氏症分子可探测定蛋白质分子可生命体学华北地区科学家共识 .临床研究学杂志 2021 年 3 月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3